MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 41657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006300	AGG	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424056
2	NC_006300	AGAT	2	8	3799	3806	50 %	25 %	25 %	0 %	52424056
3	NC_006300	ATTG	2	8	3815	3822	25 %	50 %	25 %	0 %	52424056
4	NC_006300	GAT	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424056
5	NC_006300	AT	3	6	3931	3936	50 %	50 %	0 %	0 %	52424056
6	NC_006300	TGA	3	9	3937	3945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424056
7	NC_006300	CAG	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424056
8	NC_006300	GGA	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424056
9	NC_006300	GA	3	6	4027	4032	50 %	0 %	50 %	0 %	52424056
10	NC_006300	ATT	2	6	4064	4069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424056
11	NC_006300	ATC	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424056
12	NC_006300	ATA	2	6	4424	4429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424057
13	NC_006300	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424057
14	NC_006300	ACC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424058
15	NC_006300	ATA	2	6	4665	4670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424058
16	NC_006300	GGC	2	6	4693	4698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424058
17	NC_006300	AAT	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424058
18	NC_006300	GGC	2	6	4795	4800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424058
19	NC_006300	ATT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424058
20	NC_006300	TGA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424058
21	NC_006300	TGA	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424058
22	NC_006300	ATT	2	6	4993	4998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424058
23	NC_006300	TCA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424058
24	NC_006300	TA	3	6	5043	5048	50 %	50 %	0 %	0 %	52424058
25	NC_006300	ATA	2	6	5091	5096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424058
26	NC_006300	GA	3	6	5101	5106	50 %	0 %	50 %	0 %	52424058
27	NC_006300	TGTT	2	8	5196	5203	0 %	75 %	25 %	0 %	52424059
28	NC_006300	TTC	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424059
29	NC_006300	AAT	2	6	5409	5414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424059
30	NC_006300	GAT	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424059
31	NC_006300	CTT	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424059
32	NC_006300	ATC	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424059
33	NC_006300	ATA	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424059
34	NC_006300	AATG	2	8	5749	5756	50 %	25 %	25 %	0 %	52424059
35	NC_006300	CCG	2	6	5810	5815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424059
36	NC_006300	TCA	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424059
37	NC_006300	T	6	6	5866	5871	0 %	100 %	0 %	0 %	52424059
38	NC_006300	GAT	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424059
39	NC_006300	CAT	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424059
40	NC_006300	TCATGT	2	12	6016	6027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52424059
41	NC_006300	TGT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424059
42	NC_006300	TGA	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424060
43	NC_006300	T	6	6	6233	6238	0 %	100 %	0 %	0 %	52424060
44	NC_006300	ATT	2	6	6252	6257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424060
45	NC_006300	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	52424060
46	NC_006300	CTA	2	6	6320	6325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424061
47	NC_006300	ATA	2	6	6365	6370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424061
48	NC_006300	TCT	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424061
49	NC_006300	T	6	6	6570	6575	0 %	100 %	0 %	0 %	52424061
50	NC_006300	ACGC	2	8	6621	6628	25 %	0 %	25 %	50 %	52424061
51	NC_006300	TTG	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424061
52	NC_006300	TTC	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424061
53	NC_006300	CAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424061
54	NC_006300	GCG	2	6	6763	6768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424061
55	NC_006300	TGTC	2	8	6776	6783	0 %	50 %	25 %	25 %	52424061
56	NC_006300	CG	3	6	6795	6800	0 %	0 %	50 %	50 %	52424061
57	NC_006300	CGG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424061
58	NC_006300	CAA	2	6	6879	6884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424061
59	NC_006300	GGCACC	2	12	6918	6929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	52424061
60	NC_006300	CCA	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424061
61	NC_006300	GCC	2	6	6987	6992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424061
62	NC_006300	CCG	2	6	7027	7032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424061
63	NC_006300	T	6	6	7051	7056	0 %	100 %	0 %	0 %	52424061
64	NC_006300	ATG	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424061
65	NC_006300	GCG	2	6	7132	7137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424061
66	NC_006300	ATA	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424061
67	NC_006300	T	7	7	7230	7236	0 %	100 %	0 %	0 %	52424061
68	NC_006300	TTC	2	6	7239	7244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424061
69	NC_006300	CCG	2	6	7282	7287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424061
70	NC_006300	TCCTGT	2	12	7351	7362	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	52424061
71	NC_006300	AAT	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
72	NC_006300	GCT	2	6	7763	7768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511015
73	NC_006300	GAA	2	6	7769	7774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511015
74	NC_006300	CCG	2	6	7788	7793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511015
75	NC_006300	AAG	2	6	7794	7799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511015
76	NC_006300	AAT	2	6	7805	7810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
77	NC_006300	TAA	2	6	7856	7861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
78	NC_006300	CTG	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511015
79	NC_006300	CGAA	2	8	7901	7908	50 %	0 %	25 %	25 %	161511015
80	NC_006300	TCCA	2	8	8004	8011	25 %	25 %	0 %	50 %	161511015
81	NC_006300	TTTAT	2	10	8043	8052	20 %	80 %	0 %	0 %	161511015
82	NC_006300	T	7	7	8078	8084	0 %	100 %	0 %	0 %	161511015
83	NC_006300	ATC	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511015
84	NC_006300	TTC	2	6	8156	8161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511015
85	NC_006300	TTG	2	6	8198	8203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511015
86	NC_006300	T	6	6	8248	8253	0 %	100 %	0 %	0 %	161511015
87	NC_006300	ACC	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511015
88	NC_006300	TCT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511015
89	NC_006300	GTAA	2	8	8293	8300	50 %	25 %	25 %	0 %	161511015
90	NC_006300	T	6	6	8496	8501	0 %	100 %	0 %	0 %	161511015
91	NC_006300	ATA	2	6	8508	8513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
92	NC_006300	TTG	2	6	8566	8571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424063
93	NC_006300	AAAT	2	8	8632	8639	75 %	25 %	0 %	0 %	52424063
94	NC_006300	TAA	3	9	8692	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
95	NC_006300	CGC	2	6	8748	8753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424063
96	NC_006300	AAT	2	6	8772	8777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
97	NC_006300	GGC	2	6	8809	8814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424063
98	NC_006300	TAA	2	6	8853	8858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
99	NC_006300	TGA	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424063
100	NC_006300	CCG	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424063
101	NC_006300	TAAT	2	8	9027	9034	50 %	50 %	0 %	0 %	52424063
102	NC_006300	TAA	2	6	9037	9042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
103	NC_006300	GCC	2	6	9130	9135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424063
104	NC_006300	CCG	2	6	9386	9391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424064
105	NC_006300	ACGTA	2	10	9456	9465	40 %	20 %	20 %	20 %	52424064
106	NC_006300	AAT	2	6	9519	9524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424064
107	NC_006300	TAA	2	6	9560	9565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424064
108	NC_006300	T	7	7	9641	9647	0 %	100 %	0 %	0 %	52424064
109	NC_006300	ATT	3	9	9651	9659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424064
110	NC_006300	A	7	7	9802	9808	100 %	0 %	0 %	0 %	52424065
111	NC_006300	TAA	2	6	9833	9838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424065
112	NC_006300	CAA	2	6	9861	9866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424065
113	NC_006300	TTG	2	6	9889	9894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424066
114	NC_006300	AAAC	2	8	9952	9959	75 %	0 %	0 %	25 %	52424066
115	NC_006300	TTG	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424066
116	NC_006300	CAC	2	6	10044	10049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424066
117	NC_006300	GCC	2	6	10061	10066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424066
118	NC_006300	TTTGC	2	10	10099	10108	0 %	60 %	20 %	20 %	52424066
119	NC_006300	T	6	6	10320	10325	0 %	100 %	0 %	0 %	52424066
120	NC_006300	ACC	2	6	10337	10342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424066
121	NC_006300	TGAA	2	8	10350	10357	50 %	25 %	25 %	0 %	52424066
122	NC_006300	ATA	2	6	10400	10405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424066
123	NC_006300	TTA	2	6	10666	10671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424067
124	NC_006300	T	6	6	10689	10694	0 %	100 %	0 %	0 %	52424067
125	NC_006300	TTG	2	6	10743	10748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424067
126	NC_006300	CTT	2	6	10784	10789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424067
127	NC_006300	GTT	2	6	10834	10839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424067
128	NC_006300	T	6	6	10860	10865	0 %	100 %	0 %	0 %	52424067
129	NC_006300	CAT	2	6	10866	10871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424067
130	NC_006300	TATT	2	8	10883	10890	25 %	75 %	0 %	0 %	52424067
131	NC_006300	AATC	2	8	10944	10951	50 %	25 %	0 %	25 %	52424067
132	NC_006300	CAT	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424068
133	NC_006300	AGT	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
134	NC_006300	CCG	2	6	11040	11045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
135	NC_006300	GAA	2	6	11066	11071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424068
136	NC_006300	CGC	2	6	11074	11079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
137	NC_006300	GC	3	6	11107	11112	0 %	0 %	50 %	50 %	52424068
138	NC_006300	AGT	2	6	11116	11121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
139	NC_006300	TAA	2	6	11135	11140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
140	NC_006300	AAG	2	6	11175	11180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424068
141	NC_006300	CCA	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
142	NC_006300	AAT	2	6	11360	11365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
143	NC_006300	GCAA	2	8	11478	11485	50 %	0 %	25 %	25 %	52424068
144	NC_006300	T	6	6	11513	11518	0 %	100 %	0 %	0 %	52424068
145	NC_006300	AAT	2	6	11550	11555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
146	NC_006300	AGA	2	6	11585	11590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424068
147	NC_006300	CGG	2	6	11686	11691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424068
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149	NC_006300	CCGT	2	8	11721	11728	0 %	25 %	25 %	50 %	52424068
150	NC_006300	CCA	2	6	11761	11766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
151	NC_006300	GTTT	2	8	11784	11791	0 %	75 %	25 %	0 %	52424068
152	NC_006300	TTG	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424068
153	NC_006300	TTC	2	6	11816	11821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424068
154	NC_006300	CTT	2	6	11839	11844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424068
155	NC_006300	CCCA	2	8	11937	11944	25 %	0 %	0 %	75 %	52424068
156	NC_006300	CAA	2	6	11949	11954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424068
157	NC_006300	ATG	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
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159	NC_006300	CGC	2	6	12067	12072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
160	NC_006300	CGG	2	6	12126	12131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424068
161	NC_006300	ACC	2	6	12155	12160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
162	NC_006300	GTA	2	6	12193	12198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
163	NC_006300	CCA	2	6	12217	12222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
164	NC_006300	GCAC	2	8	12231	12238	25 %	0 %	25 %	50 %	52424068
165	NC_006300	GCG	2	6	12273	12278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424068
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167	NC_006300	CGC	2	6	12320	12325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
168	NC_006300	CCA	2	6	12370	12375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
169	NC_006300	TTG	2	6	12454	12459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424068
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171	NC_006300	TAAA	2	8	12776	12783	75 %	25 %	0 %	0 %	52424069
172	NC_006300	TTC	2	6	12821	12826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424069
173	NC_006300	TTC	2	6	12857	12862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424069
174	NC_006300	TAA	2	6	12941	12946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424069
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179	NC_006300	GCC	2	6	13214	13219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424069
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215	NC_006300	TAA	2	6	14955	14960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424071
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253	NC_006300	CGC	2	6	16917	16922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424073
254	NC_006300	AAT	2	6	16924	16929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
255	NC_006300	T	6	6	16947	16952	0 %	100 %	0 %	0 %	52424073
256	NC_006300	CAC	2	6	17052	17057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424073
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259	NC_006300	ATG	2	6	17140	17145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424073
260	NC_006300	TCA	3	9	17225	17233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424073
261	NC_006300	TTGC	2	8	17237	17244	0 %	50 %	25 %	25 %	52424073
262	NC_006300	CTGA	2	8	17259	17266	25 %	25 %	25 %	25 %	52424073
263	NC_006300	CG	3	6	17279	17284	0 %	0 %	50 %	50 %	52424073
264	NC_006300	TAA	2	6	17336	17341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
265	NC_006300	CGA	2	6	17351	17356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424073
266	NC_006300	TTG	2	6	17379	17384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424073
267	NC_006300	TGG	2	6	17447	17452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424073
268	NC_006300	AATG	2	8	17533	17540	50 %	25 %	25 %	0 %	52424073
269	NC_006300	ACA	2	6	17545	17550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424073
270	NC_006300	CAATA	2	10	17568	17577	60 %	20 %	0 %	20 %	52424073
271	NC_006300	ATA	2	6	17581	17586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
272	NC_006300	GCG	3	9	17644	17652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424073
273	NC_006300	AAG	2	6	17701	17706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424073
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275	NC_006300	AAT	2	6	17754	17759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
276	NC_006300	GA	3	6	17806	17811	50 %	0 %	50 %	0 %	52424073
277	NC_006300	ATC	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424073
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279	NC_006300	TAA	2	6	17904	17909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
280	NC_006300	GTT	2	6	18016	18021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424073
281	NC_006300	CCG	2	6	18038	18043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424073
282	NC_006300	C	6	6	18044	18049	0 %	0 %	0 %	100 %	52424073
283	NC_006300	CGA	2	6	18065	18070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424073
284	NC_006300	CAT	2	6	18087	18092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424073
285	NC_006300	CAC	2	6	18158	18163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424073
286	NC_006300	CGTT	2	8	18206	18213	0 %	50 %	25 %	25 %	52424073
287	NC_006300	A	6	6	18214	18219	100 %	0 %	0 %	0 %	52424073
288	NC_006300	ATA	2	6	18235	18240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
289	NC_006300	CTTT	2	8	18268	18275	0 %	75 %	0 %	25 %	52424073
290	NC_006300	TCA	2	6	18283	18288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424073
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293	NC_006300	TAA	2	6	18411	18416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
294	NC_006300	CAT	2	6	18450	18455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424073
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298	NC_006300	TAA	2	6	18659	18664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424073
299	NC_006300	ATT	2	6	18714	18719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424073
300	NC_006300	TATT	2	8	18901	18908	25 %	75 %	0 %	0 %	52424074
301	NC_006300	AAT	2	6	18921	18926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424074
302	NC_006300	CTA	2	6	18945	18950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424074
303	NC_006300	TCA	2	6	19037	19042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424074
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391	NC_006300	GGGC	2	8	24643	24650	0 %	0 %	75 %	25 %	52424079
392	NC_006300	ATA	2	6	24654	24659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424079
393	NC_006300	GCC	2	6	24707	24712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424079
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